Les matches joués contre Gueugnon en Division 2 sont des moments particuliers dans l’année car à l’époque Gueugnon est une très forte équipe de Division 2. Les matchs ayant opposé l’AJA à la JGA Nevers et à Fontainebleau n’ont jamais été considérés comme des derbys. Contre le Stade lavallois, l’AJ Auxerre se doit de confirmer son résultat contre Châteauroux afin de figurer comme une équipe pouvant prétendre à la montée en Ligue 1. Dans un match globalement maîtrisé par les Auxerrois, les visiteurs ouvrent logiquement le score à la 63e minute par Vincent Gragnic. Jean-Luc Vannuchi essaye ensuite de garder ce score favorable en faisant rentrer des joueurs défensifs tels que Jean-Charles Castelletto ou Jamel Aït Ben Idir et passe à un système à 5 défenseurs. On y trouve les comptes-rendus des matchs, des interviews et portraits des joueurs ainsi qu’un poster au format A3. Un nouveau bâtiment accueillant les jeunes footballeurs a vu le jour ainsi qu’un nouveau terrain synthétique juxtaposé.

Nouveau lifting en 1984 avec la réfection de la grande tribune latérale. Ils sont placés dans la tribune Leclerc Bas. Philippe Guillard dans son émission parodique Le geste technique fait un sketch avec Guy Roux intitulé « Le prendage et le mettage de bonnet ». Son fils Jehan (ou Jean) de Villiers, maréchal de France, épouse Jeanne de Vallangoujard, alliance qui augmente ses terres des seigneuries de Vallangoujard, de Fontenelle (actuelle commune de Nesles-la-Vallée) et d’Amblainville. La commune est érigée en chef-lieu de canton en mars. L’idée d’un accord est venue d’une proposition d’Éric Assati, ancien joueur de l’AJ Auxerre et responsable de la formation de l’AS Excelsior. L’AJ Auxerre a recruté son premier joueur asiatique dans son histoire lors du mercato d’hiver 2011 avec l’arrivée de l’attaquant international coréen Jung Jo-gook. Ainsi Louis Clément qui en est le PDG de 1959 à 1986 est un ancien joueur de l’AJA.

En 1998, dans le film Le Dîner de cons, de Francis Veber, François Pignon joué par Jacques Villeret est supporter de l’AJA. Elle s’inscrit ainsi parfaitement dans le mouvement architectural qui, à partir des années 1950, œuvre à la construction de lieux de culte avec des formes inédites et des techniques d’avant-garde. L’asile est ensuite transformé en maison de convalescence puis en 1920 la municipalité achète les lieux pour y installer la mairie. À plusieurs reprises au début des années 1980, le stade fut transformé en salle de concert à ciel ouvert, en effet en septembre 1982, le stade est aménagé afin d’accueillir le concert de Neil Young et Dan Ar Braz. Meinau, où les installations de l’éclairage artificiel sont inaugurées, pour la réception du Stade de Reims. 26 A Cervantes, NoaNoa Cervantes 16/04/2003 (20 ans) – Stade de Reims rés. Le stade comporte 18 541 places assises. Ils ont été accueillis au stade par une banderole qui indiquait Wilkommen in Frankreich (Bienvenue en France), ce qui crée de la tension. Le budget du club a suivi l’inflation connue par le football européen au cours des années 2000, puisqu’il a été pratiquement multiplié par quatre entre 1995 et 2010, comme illustré par le tableau suivant.

Ce succès fut suivi de nombreuses victoires en Coupe Gambardella ou dans les différentes compétitions de jeunes. La filière polonaise continue dans les années 1990-2000 mais avec beaucoup moins de succès : Piotr Włodarczyk, Marcin Kuźba, Kamil Oziemczuk. Lorsque le club évolue dans les divisions inférieures (DH, CFA), l’AJ Auxerre s’appuie sur les entreprises auxerroises pour recruter des joueurs. L’image de l’AJ Auxerre est liée à celle de Guy Roux. Guy Roux accepte l’offre à condition que ce soit son grand-père qui en bénéficie jusqu’à la fin de ses jours (le grand-père de Guy Roux est alors âgé de 87 ans). Il est présent dans le club depuis début 1992-1993. Formé à l’INF Vichy, avec qui il gagne la Coupe Gambardella, il signe son premier contrat professionnel à l’Olympique de Marseille, club avec lequel il n’a disputé aucun match de championnat. Le club icaunais recrute aussi des joueurs dans les divisions inférieures du championnat de France : Lilian Laslandes (Saint-Seurin D2), Sabri Lamouchi (Alès D2), Gérald Baticle (Amiens D3), Christophe Cocard (Evreux D3), Thomas Deniaud (Ancenis D3), Cyril Jeunechamp (Nîmes D3), Hélder Esteves (Saint-Maur Lusitanos D4).